Dziedziczne mutacje genów naprawczych DNA u mężczyzn z przerzutowym rakiem prostaty czesc 4

Mutacje linii komórkowej w przypadkach przerzutów w porównaniu z ogólną populacją i przypadkami pierwotnymi. Nasza analiza dotyczyła wariantów zidentyfikowanych wśród 20 genów związanych z autosomalnymi dominującymi zespołami predysponującymi do raka, które obejmują utrzymanie integralności DNA (Tabela 2). Patogeniczność wariantów linii płciowej została ustalona zgodnie z ustalonymi kryteriami przyjętymi przez American College of Medical Genetics i Genomics and Association for Molecular Pathology oraz International Agency for Research on Cancer guidelines.24,26 Co najmniej dwóch niezależnych recenzentów ekspertów oceniło wszystkie warianty przeciwko opublikowanej literaturze i opinii publicznej bazy danych, w tym ClinVar i specyficzne dla wariantu bazy danych, oprócz baz danych częstotliwości populacji, w tym 1000 genomów i konsorcjum Exome Aggregation. Można tu znaleźć spodziewane warianty o wysokiej penetracji lub umiarkowanej penetracji sklasyfikowane jako mutacje patogenne lub prawdopodobnie patogenne. Zastosowano warianty o niskim stopniu penetracji, takie jak CHEK2 p.I157T. Analiza statystyczna
Związki między stanem mutacji genu naprawy DNA a wiekiem, rasą lub warstwami oceny Gleasona oceniano za pomocą dwustronnych testów Fishera. Częstotliwości mutacji genu naprawy DNA u 692 pacjentów z przerzutowym rakiem gruczołu krokowego oceniano w stosunku do spodziewanych częstości z Konsorcjum Agregacji Exome (53 105 osób) lub kohorty Atlasu z genomem nowotworowym (499 osób) z użyciem dwustronnego testy dwumianowe. Przeprowadziliśmy również analizy, w których wykluczono 150 mężczyzn z poprzednio zgłoszonej sprawy z serii (Tabela S5 w Dodatku uzupełniającym). Nie dokonano żadnych korekt w przypadku wielokrotnych porównań; Wartości P mniejsze niż 0,05 uważano za wskazujące na istotność statystyczną.
Wyniki
Charakterystyka pacjenta
Wszyscy 692 mężczyźni w naszej analizie udokumentowali przerzutowy rak gruczołu krokowego, określony przez histologiczną ocenę próbki z biopsji guza lub próbki chirurgicznie wycinanej. Charakterystykę demograficzną mężczyzn z każdej serii przypadków przedstawiono w tabeli 1.
Mutacje genów naprawczych genów linii komórkowej
Tabela 3. Tabela 3. Mutacje genów naprawczych genów linii komórkowej w siedmiu przypadkach przerzutowego raka gruczołu krokowego. Rysunek 1. Figura 1. Zakładane patogenne mutacje linii germinalnej. Lokalizacje mutacji i domen w białkach kodowanych przez 16 genów predyspozycji są przedstawione przez struktury Lollipop, z rodzaj mutacji oznaczony kolorem. Domeny białkowe wyróżniają się również kolorem. Na wykresie każdego genu oś x odzwierciedla liczbę reszt aminokwasowych, a oś y przedstawia całkowitą liczbę zidentyfikowanych mutacji. Spośród 20 przeanalizowanych genów, 4 (BAP1, BARD1, MLH1 i XRCC2) nie miały przypuszczalnych patogennych mutacji w linii płciowej.
Rycina 2. Ryc. 2. Rozkład podejrzewanych patogennych mutacji germinalnych. Wywołane są mutacje obejmujące 16 genów naprawy DNA. Cztery geny nie zidentyfikowały żadnych mutacji patogennych i nie są zawarte w rozkładzie.
Oceniliśmy 20 genów, które zachowują integralność DNA i są powiązane z autosomalnymi dominującymi zespołami predysponującymi do raka (Tabela 2), z zastosowaniem sekwencjonowania całego egzonu lub ukierunkowanych testów sekwencjonowania nowej generacji zaprojektowanych do badania statusu genów naprawy DNA. 692 badanych mężczyzn, 82 (11,8%) miało co najmniej jedną domniemaną chorobotwórczą mutację zarodkową w genie biorącym udział w procesach naprawy DNA (tabela 2)
[przypisy: imikwimod, grzybnie allegro, kwasowa erozja szkliwa ]

Powiązane tematy z artykułem: grzybnie allegro imikwimod kwasowa erozja szkliwa